Po smrti Nietsche

byl do čela archivu jmenován Václav Procházka, ale faktickou moc si ponechal Nádherný a pokračoval v započaté práci. Ani procházka v čele archivu nesetrval dlouho a již roku 1833 byl nahrazen Janem Salzerem který setrval v této funkci až do roku 1844. Salzer dostal oproti svým předchůdcům od Nádherného větší volnost a možnost prosadit se. Nádherný do archivu nadále docházel a důležité otázky spolu se Salzerem konzultovali.
V době Kajetána Nádherného archiv získal opět na vážnosti a bylo možno jej prakticky používat. Ačkoliv Nádherný byl především úředníkem nebránil přístupu badatelů k pramenům. Za jeho působení se tak do archivu dostal i jeho přítel Palacký a další jejichž jména se nedochovala. Badatelský ruch byl tak velký, že v roce 1833 požadoval nádherný zpřísnění podmínek pro vstup badatelů do archivu. Za éry Kajetán Nádherného se tak archiv začal plnit svoji funkci.